Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CD300CQ08708 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD300CQ08708 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms