Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL16A1Q07092 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms