Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FMODQ06828 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FMODQ06828 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FMODQ06828 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FMODQ06828 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FMODQ06828 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FMODQ06828 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FMODQ06828 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FMODQ06828 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FMODQ06828 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FMODQ06828 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FMODQ06828 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FMODQ06828 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FMODQ06828 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FMODQ06828 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FMODQ06828 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FMODQ06828 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FMODQ06828 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FMODQ06828 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FMODQ06828 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FMODQ06828 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FMODQ06828 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FMODQ06828 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FMODQ06828 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FMODQ06828 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FMODQ06828 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FMODQ06828 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FMODQ06828 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FMODQ06828 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FMODQ06828 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms