Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms