Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms