Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms