Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC18A2Q05940 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms