Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms