Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms