Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC5Q00444 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms