Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX1P78337 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX1P78337 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX1P78337 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX1P78337 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX1P78337 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX1P78337 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX1P78337 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX1P78337 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX1P78337 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX1P78337 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX1P78337 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX1P78337 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX1P78337 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX1P78337 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX1P78337 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX1P78337 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX1P78337 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX1P78337 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX1P78337 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX1P78337 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX1P78337 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX1P78337 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX1P78337 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX1P78337 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX1P78337 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX1P78337 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX1P78337 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX1P78337 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX1P78337 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX1P78337 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX1P78337 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX1P78337 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX1P78337 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX1P78337 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX1P78337 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX1P78337 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX1P78337 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX1P78337 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX1P78337 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX1P78337 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX1P78337 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX1P78337 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX1P78337 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX1P78337 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX1P78337 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX1P78337 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX1P78337 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX1P78337 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX1P78337 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX1P78337 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX1P78337 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX1P78337 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX1P78337 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX1P78337 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX1P78337 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX1P78337 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX1P78337 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX1P78337 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX1P78337 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX1P78337 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX1P78337 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX1P78337 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX1P78337 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX1P78337 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX1P78337 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX1P78337 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX1P78337 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX1P78337 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX1P78337 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX1P78337 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX1P78337 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX1P78337 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX1P78337 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX1P78337 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITX1P78337 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITX1P78337 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITX1P78337 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITX1P78337 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITX1P78337 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITX1P78337 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITX1P78337 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITX1P78337 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITX1P78337 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITX1P78337 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITX1P78337 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITX1P78337 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PITX1P78337 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITX1P78337 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITX1P78337 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITX1P78337 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITX1P78337 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITX1P78337 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITX1P78337 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX1P78337 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX1P78337 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX1P78337 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX1P78337 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX1P78337 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX1P78337 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms