Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG1P63261 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG1P63261 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG1P63261 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG1P63261 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG1P63261 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG1P63261 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG1P63261 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG1P63261 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG1P63261 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG1P63261 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG1P63261 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG1P63261 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG1P63261 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG1P63261 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG1P63261 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG1P63261 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG1P63261 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG1P63261 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG1P63261 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG1P63261 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG1P63261 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTG1P63261 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTG1P63261 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTG1P63261 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTG1P63261 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTG1P63261 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTG1P63261 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTG1P63261 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTG1P63261 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG1P63261 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG1P63261 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG1P63261 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG1P63261 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG1P63261 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG1P63261 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG1P63261 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG1P63261 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG1P63261 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG1P63261 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG1P63261 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG1P63261 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTG1P63261 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG1P63261 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG1P63261 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTG1P63261 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG1P63261 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG1P63261 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTG1P63261 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG1P63261 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG1P63261 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG1P63261 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG1P63261 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG1P63261 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG1P63261 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG1P63261 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTG1P63261 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG1P63261 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG1P63261 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG1P63261 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTG1P63261 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms