Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms