Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF3P61204 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms