Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEFSECP57772 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms