Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRP55822 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms