Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD23BP54727 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms