Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVDP53602 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVDP53602 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVDP53602 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVDP53602 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVDP53602 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVDP53602 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVDP53602 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVDP53602 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVDP53602 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVDP53602 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVDP53602 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVDP53602 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVDP53602 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MVDP53602 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVDP53602 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVDP53602 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVDP53602 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVDP53602 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVDP53602 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVDP53602 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVDP53602 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVDP53602 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MVDP53602 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MVDP53602 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MVDP53602 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MVDP53602 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MVDP53602 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MVDP53602 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MVDP53602 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MVDP53602 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MVDP53602 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MVDP53602 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MVDP53602 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MVDP53602 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MVDP53602 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MVDP53602 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MVDP53602 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MVDP53602 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MVDP53602 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MVDP53602 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MVDP53602 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MVDP53602 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MVDP53602 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MVDP53602 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MVDP53602 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MVDP53602 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MVDP53602 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MVDP53602 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MVDP53602 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MVDP53602 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MVDP53602 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MVDP53602 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MVDP53602 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms