Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOSBP53539 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOSBP53539 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOSBP53539 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOSBP53539 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOSBP53539 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOSBP53539 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOSBP53539 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOSBP53539 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOSBP53539 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOSBP53539 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOSBP53539 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FOSBP53539 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOSBP53539 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOSBP53539 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOSBP53539 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOSBP53539 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOSBP53539 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOSBP53539 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOSBP53539 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOSBP53539 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOSBP53539 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOSBP53539 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOSBP53539 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FOSBP53539 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOSBP53539 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOSBP53539 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOSBP53539 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOSBP53539 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOSBP53539 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOSBP53539 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOSBP53539 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOSBP53539 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOSBP53539 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FOSBP53539 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FOSBP53539 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FOSBP53539 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FOSBP53539 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOSBP53539 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOSBP53539 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOSBP53539 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOSBP53539 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOSBP53539 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOSBP53539 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOSBP53539 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOSBP53539 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOSBP53539 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FOSBP53539 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOSBP53539 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOSBP53539 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FOSBP53539 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOSBP53539 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOSBP53539 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FOSBP53539 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FOSBP53539 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOSBP53539 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOSBP53539 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOSBP53539 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOSBP53539 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOSBP53539 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOSBP53539 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOSBP53539 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOSBP53539 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FOSBP53539 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOSBP53539 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOSBP53539 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms