Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms