Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTBP49356 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTBP49356 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTBP49356 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTBP49356 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTBP49356 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTBP49356 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTBP49356 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTBP49356 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTBP49356 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTBP49356 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTBP49356 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTBP49356 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTBP49356 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTBP49356 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTBP49356 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTBP49356 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTBP49356 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTBP49356 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTBP49356 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTBP49356 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTBP49356 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTBP49356 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTBP49356 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTBP49356 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTBP49356 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTBP49356 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTBP49356 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTBP49356 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTBP49356 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTBP49356 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FNTBP49356 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FNTBP49356 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
FNTBP49356 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTBP49356 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTBP49356 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTBP49356 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTBP49356 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTBP49356 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTBP49356 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTBP49356 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTBP49356 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTBP49356 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTBP49356 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTBP49356 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTBP49356 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTBP49356 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTBP49356 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTBP49356 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTBP49356 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTBP49356 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTBP49356 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTBP49356 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTBP49356 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTBP49356 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTBP49356 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTBP49356 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTBP49356 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTBP49356 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTBP49356 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTBP49356 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTBP49356 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTBP49356 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTBP49356 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTBP49356 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTBP49356 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTBP49356 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTBP49356 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTBP49356 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTBP49356 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTBP49356 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTBP49356 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTBP49356 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTBP49356 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTBP49356 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTBP49356 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTBP49356 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTBP49356 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTBP49356 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTBP49356 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTBP49356 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTBP49356 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTBP49356 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTBP49356 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTBP49356 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTBP49356 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTBP49356 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTBP49356 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTBP49356 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTBP49356 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTBP49356 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTBP49356 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTBP49356 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTBP49356 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTBP49356 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTBP49356 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTBP49356 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTBP49356 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTBP49356 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTBP49356 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms