Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNNI2P48788 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms