Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX1P48742 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX1P48742 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX1P48742 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX1P48742 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX1P48742 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX1P48742 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX1P48742 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX1P48742 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX1P48742 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX1P48742 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX1P48742 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX1P48742 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX1P48742 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX1P48742 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX1P48742 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX1P48742 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX1P48742 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX1P48742 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX1P48742 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX1P48742 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX1P48742 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX1P48742 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX1P48742 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX1P48742 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX1P48742 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX1P48742 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX1P48742 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX1P48742 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX1P48742 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX1P48742 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX1P48742 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX1P48742 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX1P48742 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX1P48742 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX1P48742 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX1P48742 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX1P48742 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX1P48742 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX1P48742 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX1P48742 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX1P48742 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX1P48742 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX1P48742 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX1P48742 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX1P48742 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX1P48742 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX1P48742 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX1P48742 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX1P48742 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX1P48742 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX1P48742 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX1P48742 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX1P48742 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX1P48742 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX1P48742 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX1P48742 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX1P48742 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX1P48742 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX1P48742 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX1P48742 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX1P48742 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX1P48742 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LHX1P48742 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LHX1P48742 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms