Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD52P43351 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD52P43351 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD52P43351 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD52P43351 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD52P43351 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD52P43351 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD52P43351 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD52P43351 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD52P43351 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD52P43351 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD52P43351 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD52P43351 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD52P43351 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD52P43351 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD52P43351 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD52P43351 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD52P43351 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD52P43351 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD52P43351 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD52P43351 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD52P43351 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD52P43351 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD52P43351 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD52P43351 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD52P43351 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD52P43351 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD52P43351 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD52P43351 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD52P43351 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD52P43351 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD52P43351 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD52P43351 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD52P43351 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD52P43351 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD52P43351 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD52P43351 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD52P43351 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD52P43351 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD52P43351 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD52P43351 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD52P43351 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD52P43351 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD52P43351 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD52P43351 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD52P43351 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD52P43351 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD52P43351 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD52P43351 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD52P43351 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD52P43351 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD52P43351 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD52P43351 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAD52P43351 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms