Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL1P40616 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL1P40616 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL1P40616 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL1P40616 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL1P40616 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL1P40616 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL1P40616 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL1P40616 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL1P40616 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL1P40616 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL1P40616 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL1P40616 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL1P40616 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL1P40616 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL1P40616 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL1P40616 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL1P40616 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL1P40616 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL1P40616 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL1P40616 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL1P40616 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL1P40616 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL1P40616 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL1P40616 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL1P40616 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL1P40616 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL1P40616 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL1P40616 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL1P40616 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL1P40616 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL1P40616 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL1P40616 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL1P40616 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL1P40616 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL1P40616 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL1P40616 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL1P40616 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL1P40616 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL1P40616 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL1P40616 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL1P40616 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL1P40616 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL1P40616 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL1P40616 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL1P40616 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL1P40616 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL1P40616 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL1P40616 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL1P40616 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL1P40616 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL1P40616 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL1P40616 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms