Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 IGHV1-17-201ENST00000520119 334 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC092119.2-201ENST00000616774 1491 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 CLDN20-201ENST00000367165 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 LINC00433-201ENST00000424165 888 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 ZNF101-204ENST00000444249 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 TMEM161B-AS1-207ENST00000506584 717 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 CCND2-AS1-201ENST00000539135 555 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC005736.1-201ENST00000576810 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 TCEAL9-202ENST00000372661 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 APTX-220ENST00000476858 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD11P31277 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms