Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD10P28358 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms