Protein–RNA interactions for Protein: P27695

APEX1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX1P27695 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX1P27695 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX1P27695 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX1P27695 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX1P27695 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX1P27695 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX1P27695 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX1P27695 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX1P27695 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX1P27695 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX1P27695 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX1P27695 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX1P27695 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX1P27695 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX1P27695 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX1P27695 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX1P27695 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms