Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PLNP26678 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PLNP26678 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PLNP26678 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PLNP26678 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PLNP26678 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PLNP26678 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PLNP26678 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PLNP26678 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PLNP26678 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PLNP26678 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PLNP26678 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PLNP26678 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PLNP26678 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PLNP26678 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PLNP26678 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PLNP26678 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PLNP26678 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PLNP26678 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PLNP26678 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PLNP26678 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PLNP26678 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
PLNP26678 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PLNP26678 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PLNP26678 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PLNP26678 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PLNP26678 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms