Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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