Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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