Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB1P20618 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms