Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB9P17482 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms