Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms