Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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