Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GLI4P10075 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GLI4P10075 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms