Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HKR1P10072 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HKR1P10072 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HKR1P10072 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HKR1P10072 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HKR1P10072 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HKR1P10072 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HKR1P10072 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HKR1P10072 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HKR1P10072 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HKR1P10072 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HKR1P10072 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HKR1P10072 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HKR1P10072 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HKR1P10072 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HKR1P10072 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HKR1P10072 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HKR1P10072 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HKR1P10072 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HKR1P10072 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HKR1P10072 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HKR1P10072 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HKR1P10072 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HKR1P10072 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
HKR1P10072 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
HKR1P10072 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HKR1P10072 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HKR1P10072 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms