Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI3P10071 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI3P10071 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI3P10071 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI3P10071 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI3P10071 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI3P10071 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI3P10071 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI3P10071 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI3P10071 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI3P10071 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI3P10071 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI3P10071 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI3P10071 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI3P10071 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI3P10071 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI3P10071 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI3P10071 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI3P10071 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI3P10071 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI3P10071 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI3P10071 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI3P10071 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI3P10071 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI3P10071 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI3P10071 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI3P10071 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI3P10071 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI3P10071 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI3P10071 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI3P10071 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI3P10071 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI3P10071 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI3P10071 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI3P10071 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI3P10071 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI3P10071 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI3P10071 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI3P10071 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI3P10071 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI3P10071 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI3P10071 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI3P10071 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI3P10071 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI3P10071 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI3P10071 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI3P10071 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI3P10071 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI3P10071 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI3P10071 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI3P10071 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI3P10071 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI3P10071 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI3P10071 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI3P10071 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI3P10071 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI3P10071 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI3P10071 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI3P10071 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI3P10071 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI3P10071 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI3P10071 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI3P10071 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI3P10071 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI3P10071 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI3P10071 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI3P10071 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI3P10071 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI3P10071 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI3P10071 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLI3P10071 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLI3P10071 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLI3P10071 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLI3P10071 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLI3P10071 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLI3P10071 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLI3P10071 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
GLI3P10071 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLI3P10071 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLI3P10071 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLI3P10071 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLI3P10071 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLI3P10071 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLI3P10071 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GLI3P10071 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLI3P10071 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI3P10071 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI3P10071 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI3P10071 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI3P10071 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI3P10071 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI3P10071 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI3P10071 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI3P10071 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI3P10071 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI3P10071 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI3P10071 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI3P10071 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI3P10071 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI3P10071 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms