Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD3P0DMS9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms