Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TYMSP04818 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TYMSP04818 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TYMSP04818 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TYMSP04818 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TYMSP04818 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TYMSP04818 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TYMSP04818 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TYMSP04818 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TYMSP04818 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TYMSP04818 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TYMSP04818 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TYMSP04818 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TYMSP04818 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TYMSP04818 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TYMSP04818 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TYMSP04818 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TYMSP04818 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TYMSP04818 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TYMSP04818 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TYMSP04818 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TYMSP04818 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TYMSP04818 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TYMSP04818 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TYMSP04818 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TYMSP04818 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TYMSP04818 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TYMSP04818 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TYMSP04818 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TYMSP04818 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TYMSP04818 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TYMSP04818 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TYMSP04818 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TYMSP04818 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TYMSP04818 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TYMSP04818 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TYMSP04818 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TYMSP04818 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TYMSP04818 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TYMSP04818 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TYMSP04818 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TYMSP04818 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TYMSP04818 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TYMSP04818 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TYMSP04818 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TYMSP04818 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TYMSP04818 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms