Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1GO43497 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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