Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRPF3O43395 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRPF3O43395 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms