Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PHF1O43189 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PHF1O43189 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF1O43189 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF1O43189 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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