Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCER2I3L3R5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCER2I3L3R5 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms