Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E9PBE3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E9PBE3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E9PBE3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms