Protein–RNA interactions for Protein: A6NHL2

TUBAL3, Tubulin alpha chain-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBAL3A6NHL2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBAL3A6NHL2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBAL3A6NHL2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBAL3A6NHL2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBAL3A6NHL2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBAL3A6NHL2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBAL3A6NHL2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBAL3A6NHL2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBAL3A6NHL2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBAL3A6NHL2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBAL3A6NHL2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBAL3A6NHL2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBAL3A6NHL2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBAL3A6NHL2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBAL3A6NHL2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBAL3A6NHL2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBAL3A6NHL2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBAL3A6NHL2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBAL3A6NHL2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBAL3A6NHL2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBAL3A6NHL2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBAL3A6NHL2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBAL3A6NHL2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBAL3A6NHL2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBAL3A6NHL2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBAL3A6NHL2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBAL3A6NHL2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBAL3A6NHL2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBAL3A6NHL2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBAL3A6NHL2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms