Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAF3IP3Q9Y228 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAF3IP3Q9Y228 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAF3IP3Q9Y228 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAF3IP3Q9Y228 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAF3IP3Q9Y228 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAF3IP3Q9Y228 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAF3IP3Q9Y228 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAF3IP3Q9Y228 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAF3IP3Q9Y228 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAF3IP3Q9Y228 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAF3IP3Q9Y228 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAF3IP3Q9Y228 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAF3IP3Q9Y228 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAF3IP3Q9Y228 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAF3IP3Q9Y228 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAF3IP3Q9Y228 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAF3IP3Q9Y228 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAF3IP3Q9Y228 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAF3IP3Q9Y228 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAF3IP3Q9Y228 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAF3IP3Q9Y228 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAF3IP3Q9Y228 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAF3IP3Q9Y228 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAF3IP3Q9Y228 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAF3IP3Q9Y228 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAF3IP3Q9Y228 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAF3IP3Q9Y228 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAF3IP3Q9Y228 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAF3IP3Q9Y228 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TRAF3IP3Q9Y228 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAF3IP3Q9Y228 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAF3IP3Q9Y228 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAF3IP3Q9Y228 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAF3IP3Q9Y228 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAF3IP3Q9Y228 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAF3IP3Q9Y228 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAF3IP3Q9Y228 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAF3IP3Q9Y228 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAF3IP3Q9Y228 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAF3IP3Q9Y228 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAF3IP3Q9Y228 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAF3IP3Q9Y228 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAF3IP3Q9Y228 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAF3IP3Q9Y228 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAF3IP3Q9Y228 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAF3IP3Q9Y228 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAF3IP3Q9Y228 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAF3IP3Q9Y228 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAF3IP3Q9Y228 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAF3IP3Q9Y228 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAF3IP3Q9Y228 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAF3IP3Q9Y228 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAF3IP3Q9Y228 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAF3IP3Q9Y228 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAF3IP3Q9Y228 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAF3IP3Q9Y228 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAF3IP3Q9Y228 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAF3IP3Q9Y228 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAF3IP3Q9Y228 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAF3IP3Q9Y228 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAF3IP3Q9Y228 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRAF3IP3Q9Y228 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAF3IP3Q9Y228 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRAF3IP3Q9Y228 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.3 ms