Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASP8AP2Q9UKL3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP8AP2Q9UKL3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP8AP2Q9UKL3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP8AP2Q9UKL3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP8AP2Q9UKL3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP8AP2Q9UKL3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP8AP2Q9UKL3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP8AP2Q9UKL3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP8AP2Q9UKL3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP8AP2Q9UKL3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CASP8AP2Q9UKL3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CASP8AP2Q9UKL3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CASP8AP2Q9UKL3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CASP8AP2Q9UKL3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CASP8AP2Q9UKL3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CASP8AP2Q9UKL3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASP8AP2Q9UKL3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASP8AP2Q9UKL3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASP8AP2Q9UKL3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASP8AP2Q9UKL3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASP8AP2Q9UKL3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CASP8AP2Q9UKL3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CASP8AP2Q9UKL3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CASP8AP2Q9UKL3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CASP8AP2Q9UKL3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASP8AP2Q9UKL3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASP8AP2Q9UKL3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CASP8AP2Q9UKL3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASP8AP2Q9UKL3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASP8AP2Q9UKL3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASP8AP2Q9UKL3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASP8AP2Q9UKL3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASP8AP2Q9UKL3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CASP8AP2Q9UKL3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CASP8AP2Q9UKL3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CASP8AP2Q9UKL3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CASP8AP2Q9UKL3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CASP8AP2Q9UKL3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASP8AP2Q9UKL3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASP8AP2Q9UKL3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASP8AP2Q9UKL3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CASP8AP2Q9UKL3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CASP8AP2Q9UKL3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CASP8AP2Q9UKL3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CASP8AP2Q9UKL3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CASP8AP2Q9UKL3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CASP8AP2Q9UKL3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CASP8AP2Q9UKL3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CASP8AP2Q9UKL3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CASP8AP2Q9UKL3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CASP8AP2Q9UKL3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CASP8AP2Q9UKL3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CASP8AP2Q9UKL3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASP8AP2Q9UKL3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASP8AP2Q9UKL3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASP8AP2Q9UKL3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CASP8AP2Q9UKL3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASP8AP2Q9UKL3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms