Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.57■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.54■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.54■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
USP25Q9UHP3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP25Q9UHP3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
USP25Q9UHP3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms