Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDP1Q9P0J1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDP1Q9P0J1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDP1Q9P0J1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms